Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSBN1Q5VWQ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms