Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms