Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGEF3Q5TH69 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGEF3Q5TH69 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms