Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
L1TD1Q5T7N2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms