Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms