Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D3Q587I9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms