Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LACTB2Q53H82 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms