Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms