Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MSMPQ1L6U9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MSMPQ1L6U9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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