Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SSX1Q16384 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SSX1Q16384 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SSX1Q16384 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SSX1Q16384 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SSX1Q16384 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SSX1Q16384 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SSX1Q16384 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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