Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CNGA3Q16281 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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