Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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