Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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