Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB35Q15286 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB35Q15286 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms