Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
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PTPRKQ15262 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
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PTPRKQ15262 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
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PTPRKQ15262 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRKQ15262 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
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PTPRKQ15262 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
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