Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK1Q15118 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK1Q15118 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK1Q15118 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK1Q15118 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK1Q15118 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK1Q15118 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDK1Q15118 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms