Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms