Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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