Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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COL4A6Q14031 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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COL4A6Q14031 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COL4A6Q14031 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
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