Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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