Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RUNX3Q13761 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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