Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3CQ13748 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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