Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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