Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRQ13535 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRQ13535 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATRQ13535 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRQ13535 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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ATRQ13535 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRQ13535 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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