Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BFSP2Q13515 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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