Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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