Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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