Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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