Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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