Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPS1Q13098 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms