Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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FOXC1Q12948 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FOXC1Q12948 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FOXC1Q12948 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FOXC1Q12948 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FOXC1Q12948 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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FOXC1Q12948 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FOXC1Q12948 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXC1Q12948 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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