Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GTF3C1Q12789 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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GTF3C1Q12789 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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GTF3C1Q12789 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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GTF3C1Q12789 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF3C1Q12789 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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