Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
HMGXB3Q12766 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGXB3Q12766 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
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