Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms