Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CYP4F3Q08477 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms