Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4BQ07343 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms