Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABPB1Q06547 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms