Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC9Q06265 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms