Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms