Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB1Q02818 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms