Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms