Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXA4Q00056 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA4Q00056 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms