Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMO4P61968 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMO4P61968 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO4P61968 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms