Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms