Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms