Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms