Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTBP2P56545 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms