Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLTPP55058 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLTPP55058 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLTPP55058 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLTPP55058 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLTPP55058 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLTPP55058 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLTPP55058 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLTPP55058 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLTPP55058 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms