Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB28P51157 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB28P51157 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB28P51157 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB28P51157 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB28P51157 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB28P51157 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB28P51157 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB28P51157 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms