Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF6P49848 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF6P49848 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF6P49848 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF6P49848 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF6P49848 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF6P49848 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF6P49848 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF6P49848 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF6P49848 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms